Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms