Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AP5B1Q2VPB7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AP5B1Q2VPB7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms