Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RTN1Q16799 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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RTN1Q16799 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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RTN1Q16799 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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RTN1Q16799 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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RTN1Q16799 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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RTN1Q16799 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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RTN1Q16799 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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RTN1Q16799 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RTN1Q16799 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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