Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CA9Q16790 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CA9Q16790 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CA9Q16790 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CA9Q16790 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CA9Q16790 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CA9Q16790 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CA9Q16790 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CA9Q16790 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CA9Q16790 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CA9Q16790 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CA9Q16790 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CA9Q16790 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms