Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GTF2H3Q13889 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2H3Q13889 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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