Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
APOFQ13790 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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