Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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TUBB3Q13509 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB3Q13509 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms