Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.461e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.887e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 ARHGDIA-215ENST00000583868 815 ntTSL 316.62■□□□□ 0.257e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 SNRPB-203ENST00000474384 985 ntTSL 521.33■■□□□ 1.016e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.666e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.646e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.529e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.499e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.449e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.439e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.369e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.369e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.169e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.119e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.671e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.356e-9■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TPI1-204ENST00000474253 427 ntTSL 1 (best)13.81□□□□□ -0.22e-15■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 MAP2K2-210ENST00000601786 1778 ntTSL 221.26■□□□□ 0.991e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 MAP2K2-209ENST00000600584 2926 ntTSL 216.37■□□□□ 0.211e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 MAP2K2-206ENST00000597263 552 ntTSL 311.64□□□□□ -0.551e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 NUDCD2-203ENST00000519395 662 ntTSL 56.28□□□□□ -1.44e-10■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 NUDCD2-204ENST00000521797 652 ntTSL 35.86□□□□□ -1.474e-10■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 DRAP1-203ENST00000525190 474 nt27.11■■□□□ 1.935e-12■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.579e-10■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.319e-10■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 EIF3K-210ENST00000591409 583 ntTSL 315.78■□□□□ 0.129e-10■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 AKT1-205ENST00000553506 2830 ntTSL 221.74■■□□□ 1.074e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 AKT1-218ENST00000557552 8396 ntTSL 518.01■□□□□ 0.474e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 AKT1-213ENST00000555458 705 ntTSL 217.33■□□□□ 0.364e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 AKT1-219ENST00000610370 3187 ntTSL 214.8□□□□□ -0.044e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.211e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 PTRH1-202ENST00000414832 569 ntTSL 326.83■■□□□ 1.895e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.775e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TM7SF2-217ENST00000530650 2094 ntTSL 1 (best)24.48■■□□□ 1.515e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TM7SF2-216ENST00000529601 1671 ntTSL 224.04■■□□□ 1.445e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.435e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 HDGFL2-203ENST00000592417 1349 ntTSL 223.97■■□□□ 1.435e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 PRPSAP2-202ENST00000395656 1540 ntTSL 223.66■■□□□ 1.385e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 HDGFL2-206ENST00000614903 239 ntTSL 523.64■■□□□ 1.375e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.365e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TM7SF2-214ENST00000529292 1305 ntTSL 523.48■■□□□ 1.355e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.35e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.175e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.171e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 HDGFL2-201ENST00000587016 870 ntTSL 322.08■■□□□ 1.135e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 ENOSF1-211ENST00000581475 1745 ntTSL 1 (best)21.21■□□□□ 0.995e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.874e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.871e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.835e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 PHGDH-214ENST00000641314 1558 nt20.05■□□□□ 0.85e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 C17orf49-206ENST00000549857 2343 ntTSL 219.97■□□□□ 0.791e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TM7SF2-212ENST00000528802 692 ntTSL 319.85■□□□□ 0.775e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 CLUH-211ENST00000575014 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.73■□□□□ 0.752e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 PHGDH-232ENST00000641947 1774 nt19.7■□□□□ 0.745e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TM7SF2-206ENST00000526048 1168 ntTSL 519.62■□□□□ 0.735e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 HDGFL2-207ENST00000615225 3100 ntTSL 519.61■□□□□ 0.735e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 C17orf49-205ENST00000547747 430 ntTSL 318.6■□□□□ 0.571e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.562e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.495e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 PHGDH-231ENST00000641939 540 nt18.05■□□□□ 0.485e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.475e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.461e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 C17orf49-204ENST00000547709 626 ntTSL 317.9■□□□□ 0.461e-6■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.332e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 NDRG1-217ENST00000521414 2349 ntTSL 216.33■□□□□ 0.25e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 SUMF2-217ENST00000498777 570 ntTSL 216.15■□□□□ 0.185e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 SORD-206ENST00000559562 864 ntTSL 515.74■□□□□ 0.115e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 NDRG1-216ENST00000521026 2145 ntTSL 215.58■□□□□ 0.085e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 VPS28-216ENST00000533806 650 ntTSL 315.46■□□□□ 0.078e-10■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 SORD-205ENST00000559230 1502 ntTSL 1 (best)13.95□□□□□ -0.185e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 PFAS-205ENST00000580356 4242 ntTSL 213.92□□□□□ -0.185e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.245e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 NDRG1-204ENST00000517599 2918 ntTSL 213.37□□□□□ -0.275e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 PRPSAP2-222ENST00000574451 1019 ntTSL 312.84□□□□□ -0.355e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 NDRG1-201ENST00000323851 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.465e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 SORD-203ENST00000558580 1395 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.465e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 MTR-205ENST00000535889 10405 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.465e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TMEM179B-203ENST00000532345 845 ntTSL 212.13□□□□□ -0.475e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TM7SF2-210ENST00000527968 544 ntTSL 312.09□□□□□ -0.475e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 NDRG1-229ENST00000537882 2975 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.485e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 MTR-202ENST00000366577 10529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.585e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 NDRG1-218ENST00000521438 2810 ntTSL 211.36□□□□□ -0.595e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 PRPSAP2-205ENST00000419071 1491 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.65e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 TMEM179B-202ENST00000526546 400 ntTSL 211.02□□□□□ -0.655e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 SORD-201ENST00000267814 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.665e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 UBE3C-205ENST00000470408 5197 ntTSL 210.8□□□□□ -0.684e-7■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 MRPS18C-205ENST00000507349 350 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.715e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 RTN4IP1-204ENST00000539449 814 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.755e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 ENOSF1-217ENST00000584259 6340 ntTSL 210.31□□□□□ -0.765e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 NDRG1-212ENST00000519278 3983 ntTSL 210.19□□□□□ -0.785e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 ASAH1-268ENST00000638028 2393 ntTSL 210.15□□□□□ -0.785e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 ASAH1-214ENST00000635756 1589 ntTSL 58.61□□□□□ -1.035e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 ASAH1-257ENST00000637752 2708 nt8.6□□□□□ -1.035e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 ASAH1-230ENST00000636563 1891 ntTSL 58.44□□□□□ -1.065e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 ASAH1-246ENST00000637343 3671 ntTSL 47.85□□□□□ -1.155e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 ASAH1-206ENST00000518746 3870 ntTSL 27.44□□□□□ -1.225e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 ENOSF1-219ENST00000584646 752 ntTSL 26.99□□□□□ -1.295e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 MRPS18C-203ENST00000505719 490 ntTSL 36.39□□□□□ -1.395e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.395e-8■■□□□ 13.9
PABPC4Q13310 MRPS18C-202ENST00000505525 442 ntTSL 36.37□□□□□ -1.395e-8■■□□□ 13.9
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