Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL28Q13084 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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