Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms