Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SCN1BQ07699 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms