Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ARID5AQ03989 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ARID5AQ03989 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms