Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SMARCA2P51531 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMARCA2P51531 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms