Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB28P51157 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB28P51157 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB28P51157 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms