Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TGM4P49221 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TGM4P49221 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms