Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACTN2P35609 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms