Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MSR1P21757 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSR1P21757 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSR1P21757 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSR1P21757 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSR1P21757 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSR1P21757 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSR1P21757 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MSR1P21757 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MSR1P21757 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSR1P21757 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSR1P21757 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MSR1P21757 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MSR1P21757 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSR1P21757 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSR1P21757 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSR1P21757 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSR1P21757 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MSR1P21757 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSR1P21757 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MSR1P21757 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms