Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HPGDP15428 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HPGDP15428 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms