Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMC1P11047 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMC1P11047 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms