Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HSP90AB1P08238 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms