Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVV-1B6SEH8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms