Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms