Protein–RNA interactions for Protein: A6NK97

SLC22A20, Solute carrier family 22 member 20, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A20A6NK97 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC22A20A6NK97 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms