Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PCSK1NQ9UHG2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms