Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
POLR2J2Q9GZM3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
POLR2J2Q9GZM3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms