Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TUBB6Q9BUF5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms