Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SEC22CQ9BRL7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SEC22CQ9BRL7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SEC22CQ9BRL7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SEC22CQ9BRL7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SEC22CQ9BRL7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SEC22CQ9BRL7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SEC22CQ9BRL7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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