Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC35A4Q96G79 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms