Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP3Q8WYN3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP3Q8WYN3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms