Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNX33Q8WV41 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNX33Q8WV41 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms