Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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CLDN19Q8N6F1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CLDN19Q8N6F1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CLDN19Q8N6F1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CLDN19Q8N6F1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CLDN19Q8N6F1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CLDN19Q8N6F1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLDN19Q8N6F1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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