Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A3Q7Z3Q1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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