Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCDC80Q76M96 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms