Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMARCD3Q6STE5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms