Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 HDAC2-207ENST00000520170 690 ntTSL 217.63■□□□□ 0.412e-10■■■■■ 29.2
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PRPF8Q6P2Q9 CTSB-227ENST00000533110 399 ntTSL 58.36□□□□□ -1.077e-8■■■■■ 29.2
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PRPF8Q6P2Q9 EIF4B-213ENST00000552490 841 ntTSL 27.28□□□□□ -1.243e-8■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 ERMARD-203ENST00000366773 2141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.287e-8■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 CCDC174-202ENST00000383794 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.317e-8■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 KANSL3-214ENST00000476534 2675 ntTSL 26.79□□□□□ -1.327e-7■■■■■ 29.2
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PRPF8Q6P2Q9 DDX46-204ENST00000505592 555 ntTSL 23.42□□□□□ -1.867e-8■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 CHD2-220ENST00000630813 452 ntTSL 23.34□□□□□ -1.877e-8■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 TRIT1-207ENST00000467774 464 ntTSL 20.01□□□□□ -2.417e-8■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 PSMD13-209ENST00000529372 612 ntTSL 511.21□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 PSMD13-206ENST00000527047 1284 ntTSL 1 (best)9.89□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 CCT4-202ENST00000461370 388 ntTSL 23.43□□□□□ -1.862e-13■■■■■ 29.2
PRPF8Q6P2Q9 NAPRT-201ENST00000340490 1774 ntTSL 1 (best)19.67■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 29.2
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