Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC93Q567U6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC93Q567U6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms