Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
KRTAP25-1Q3LHN0 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms