Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FHOD3Q2V2M9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FHOD3Q2V2M9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms