Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMS2P11Q13670 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms