Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms