Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRKCDQ05655 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRKCDQ05655 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms