Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP6P55212 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP6P55212 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP6P55212 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP6P55212 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP6P55212 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP6P55212 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CASP6P55212 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CASP6P55212 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms