Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP7BP35670 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP7BP35670 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms