Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME2P23368 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME2P23368 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME2P23368 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME2P23368 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME2P23368 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME2P23368 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ME2P23368 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ME2P23368 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ME2P23368 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ME2P23368 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ME2P23368 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ME2P23368 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms