Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBL4AP11441 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBL4AP11441 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBL4AP11441 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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