Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPB9F8W1W9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms