Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NPIPA2E9PIF3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPA2E9PIF3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms