Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HACD1B0YJ81 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HACD1B0YJ81 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms