Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC160A6NGH7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms