Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HIF3AQ9Y2N7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms